В мире, где монстры давно вышли из тени и интегрировались в общество, существует уникальная академия «Гакумон» — элитная школа-интернат, куда принимают только самых одарённых представителей обоих миров: людей и сверхъестественных существ. Главный герой, обычный парень по имени Кэйто, совершенно неожиданно для себя получает заветное приглашение, хотя не обладает ни магическими способностями, ни сверхсилой. Вскоре выясняется, что он зачислен на особый, экспериментальный факультет «Синергия», куда попали столь же странные и, на первый взгляд, бесперспективные студенты. Их задача — не просто учиться, а найти точки соприкосновения между магией и технологиями, древними инстинктами и человеческой логикой, преодолевая вековую предвзятость. Однако за стенами престижного заведения скрывается тёмная тайна: сама школа является живым организмом и полигоном для рискованных исследований, а судьба всего хрупкого мира сосуществования может зависеть от этой пёстрой группы неудачников.
По мере погружения в учёбу Кэйто и его новые друзья — застенчивая вампирша-гений, оборотень-технофоб с добрым сердцем и кицунэ, разучившаяся управлять своими иллюзиями, — начинают раскрывать аномалии «Гакумона». Классные комнаты меняют геометрию, в запретном крыле слышатся странные звуки, а влиятельные студенты из традиционных кланов смотрят на факультет «Синергия» с подозрением и враждебностью. Чтобы выжить в этой среде и раскрыть свой истинный потенциал, ребятам придётся научиться не просто терпеть различия друг друга, а превратить их в единую силу. Им предстоит столкнуться с древними ритуалами, механическими кошмарами и политическими интригами, где на кону стоит будущее как мира людей, так и мира монстров. Их единственным оружием становится «гакумон» — жажда познания и искренняя дружба, способная бросить вызов любым предрассудкам и даже самой мрачной судьбе.