В мире, где мифические существа скрываются среди людей, живет обычный школьник Котаро Авадзима. Его жизнь кардинально меняется, когда он узнает, что его покойный дед, знаменитый исследователь, оставил ему необычное наследство — «Атлас Авадзимы». Эта древняя книга содержит секреты и обещание: тот, кто запечатлеет сто видов редких и скрытных существ — ёкаев, духов и мифических зверей, — получит невероятную силу. Однако Котаро быстро понимает, что задача не сводится к простой фотоохоте. Каждое существо обладает своей уникальной историей, болью и связью с человеческим миром. Чтобы сделать истинный «снимок», наполненный сущностью существа, ему предстоит разрешить их проблемы, помочь им и установить подлинную связь, превратившись из простого коллекционера в посредника между двумя мирами.
Путешествуя по современной Японии, которая таит в себе древнюю магию, Котаро не одинок. К нему присоединяется загадочная девушка Юки, сама являющаяся одним из «видов», и верный друг детства, скептик Такуми. Вместе они сталкиваются не только с чудесами, но и с опасностями, исходящими от тайной организации, стремящейся захватить мифических существ для собственных целей. Каждая новая встреча — это испытание души для Котаро, заставляющее его пересмотреть свои мотивы и понять, что истинная ценность наследия деда заключается не в конечной награде, а в самом пути, в хрупких и прекрасных моментах взаимопонимания между человеком и чудом. Его миссия постепенно превращается в грандиозную летопись уходящей магии в современном мире.