Обычный старшеклассник Кён, мечтающий только о спокойной жизни, оказывается втянут в водоворот абсурда, едва переступив порог школы. Всему виной Харухи Судзумия — девушка с экстравагантными взглядами и железной волей, которая не признает серости будней. С первого взгляда она заявляет, что её интересуют только пришельцы, путешественники во времени, экстрасенсы и прочие представители необычного. Чтобы не дать скуке поглотить мир, Харухи создаёт школьный клуб — Бригаду SOS, куда насильно записывает Кёна. Вскоре к ним присоединяются тихоня Юки Нагато, застенчивый библиотекарь Рёко Асакура и загадочный Микуру Асахина. Кён быстро понимает, что его новая знакомая не просто чудачка: Харухи обладает подсознательной способностью изменять реальность по своему желанию. Любая её прихоть, от скуки до разочарования, может привести к катастрофе — исчезновению людей, перестройке мира или вторжению из параллельных измерений.
Однако самое страшное кроется в том, что все члены Бригады SOS — вовсе не обычные люди. Юки Нагато — инопланетный интерфейс, созданный для наблюдения за Харухи. Микуру Асахина — путешественница во времени из будущего, а Ицуки Коидзуми — экстрасенс, который сражается с «закрытыми пространствами», порождаемыми эмоциями Харухи. Их задача — любой ценой поддерживать её хорошее настроение и направлять энергию в безопасное русло. Кён оказывается единственным обычным человеком, но именно он становится тем якорем, который удерживает Харухи от необдуманных поступков. Пока девушка с энтузиазмом ищет тайны мироздания, снимая любительские фильмы и участвуя в бейсбольных турнирах, её друзья балансируют на грани между спасением мира и желанием просто выжить среди хаоса, который она невольно создаёт. Это история о том, как скука одного человека может стать угрозой для всей вселенной, а дружба — единственным способом удержать реальность от распада.
