В Токио, где небоскребы отражают багровый закат, начинается Священная война за Святой Грааль. Но этот Грааль — не просто чаша, а ключ к исполнению любого желания, и цена за него — жизнь. Семи магам, Мастерам, предстоит призвать легендарных героев из прошлого, Слуг, и сражаться до последнего. Среди них — Аяка Садзё, обычная школьница, которая оказывается втянутой в эту бойню против своей воли. Её Слуга — Сэйбер, рыцарь в сияющих доспехах, но не тот, кого можно узнать из учебников истории. Он — мужская версия Короля Артура, Артурия Пендрагон, чья легенда переписана кровью и сталью. Вместе они противостоят другим Мастерам: циничному детективу, одержимому идеалисту и безжалостному священнику. Каждый из них верит, что Грааль оправдает любые жертвы, но за фасадом войны скрывается тайна: предыдущая битва была уничтожена, и лишь немногие помнят, что истинная цель Грааля — не исполнение желаний, а пробуждение древнего зла.
По мере того как Сэйбер и Аяка пробиваются сквозь вереницу дуэлей и предательств, они сталкиваются с Райдером — Александром Македонским, чья жажда завоеваний не знает границ, и с Арчером — загадочным стрелком, чьи стрелы пронзают саму реальность. Но главная угроза исходит от Кастера, мага, который призвал не героя, а чудовище — бессмертного змея, пожирающего души. В разгар битвы выясняется, что Сэйбер скрывает проклятие: его меч, Экскалибур, несёт в себе не свет, а тьму, способную уничтожить всё живое. Аяка, разрываясь между страхом и долгом, узнаёт, что её собственная кровь — ключ к управлению этим оружием. Когда Грааль наконец проявляется, он оказывается не сосудом, а вратами в мир, где время течёт вспять. Сэйбер, осознав, что его легенда была искажена, жертвует собой, чтобы закрыть врата, оставляя Аяку с выбором: забыть всё и жить обычной жизнью или принять наследие войны и стать новым хранителем равновесия. В финале, стоя на руинах города, она понимает, что Священная война никогда не заканчивается — она лишь ждёт следующего проигравшего.
